Primer Premier 6是一款来自加拿大的专业引物设计软件，主要功能包括引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA基元查找等，给专业人士提供了很大的便利。它的最新版本6.25在功能上更加强大，支持快速和自动化的引物设计，并且兼容Windows 7系统。
这款软件操作简单，用户可以直接输入模板序列到指定网页（如primer3）获取设计好的引物，也可以在本地运行软件进行设计。它适用于PCR、测序引物以及杂交探针的设计，功能非常全面，包括CR引物设计、跨物种扩增、致病性检测等多种用途。
界面分为四个主要部分：序列编辑窗口、引物设计窗口、酶切分析窗口和基元分析窗口。通过手动拖动鼠标即可快速找到所需片段的引物，并实时显示参数变化和可能的二聚体或发夹结构。软件还支持自定义条件，自动搜索最优引物对。
总的来说，Primer Premier 6是一款非常实用的工具，尤其适合需要精准设计引物的研究人员和实验室人员。如果你正在寻找一款高效且功能强大的引物设计软件，这款绝对值得试试！
Primer Premier 6是加拿大Premier公司推出的一款专业的引物设软件，软件主体分为四大部分，尤其常用的是引物设计、限制性内切酶位点分析和DNA基元（motif）查找，给专业人员带来的极大的便利。
小编为大家带来的Primer Premier 6.25最新版本功能更加强大，立足点也是按照引物设计的基本原则，只是更加快速和自动化而已。我们可以直接提交模板序列到特定网页，如著名的primer3，得到设计好的引物，也可以在本地计算机上运行引物设计专业软件，支持win7 操作系统，具有PCR或测序引物以及杂交探针设计功能，有需要的朋友请下载体验。
软件功能
1、CR引物设计：设计引物对用于PCR和多重实验。
2、跨物种：扩增来自多个物种的序列。
3、致病性检测：在高度保守的区域中定位寡核苷酸。
4、等位基因特异性：仅扩增一组相关序列中的单个成员。
5、简并：从氨基酸序列开始，反向翻译并自动设计低简并区域的寡核苷酸。
6、嵌套/多重：检查多个候选寡核苷酸之间的同源性。
7、限制酶和基序分析：从数据库中选择800多种酶和200种常见基序。
8、Clustal W比对：使用任何资源（包括EBI）在执行ClustalW比对后加载比对序列。
9、多序列比对：使用流行的Clustal W算法来对齐桌面上的序列（仅适用于Windows版本）。
10、算法：使用Breslauer值计算Tm。
长PCR-处理最多50 KB的序列。
软件特色
1、主要界面可分为序列编辑窗口（Genetank），引物设计窗口（Primer Design），酶切分析窗口（Restriction Sites）和纹基分析窗口（Motif）四大块
2、该软件就是用来进行引物设计的，进行这些操作非常简单
3、可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物
4、在手动的任何时候，下面显示各种参数的改变和可能的二聚体、异 二聚体、发夹结构等。也可以给定条件，让软件自动搜索引物，并将引物分析结果显示出来
primer6设计引物教程
1、首先，选取目的基因序列，对格式没有什么要求，只需要将目的基因序列复制就可以。
2、打开File目录下的New，选择Sequence。这里的另一个project选项是导入文件的方式，也就是将目的基因以文件形式保存的可以直接导入文件。一般通过复制的方式会更方便。
3、打开Sequence后，会弹出粘贴框，只需要将刚刚复制的基因序列粘贴上即可，然后点击下方的Add。
4、选择上方的红蓝双向箭头的按钮进行引物设计，在设计开始前可以更改设计的参数，包括搜索的碱基范围、引物的长度，碱基数，设计结果显示的引物对数等。
5、设置完参数后，点击下方的Search，软件开始分析设计，完成后，点击OK。设计结果就会在下面显示出来。
6、结果中蓝色为前引物，红色为后引物，Rating是对引物的综合评价分数，在上方也会显示引物的优劣，最好的为Best，中等为Good，最次的为Poor。一般选择引物都为Best或Good，其它显示均是无法使用的。
7、在右边还有两个选项，All Primers可以查看可选择的多对不同引物。可以根据需要选择合适位置和适当产物长度的引物。选择后需要点击下方的Replace才能替换。
8、All Structers则可以查看当前选定引物的结构，如发夹结构，引物二聚体和重复碱基等。
9、引物选定完成后，点击下方的引物序列，再右键会弹出复制信息选项，进而将设计好的引物导出。也可以直接以文件的形式将结果导出。
更新日志
v6.25版本
升级适应了 NCBI-BLAST 服务器上可用的最新基因组数据库以及 NCBI 最近在其网站和服务上所做的更改，以提高安全性和隐私性。
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